Debido a la gran diversidad de seres vivos que habitan los diferentes ecosistemas del planeta, la ecología se divide en áreas de estudio para resolver preguntas específicas. La ecología a nivel de organismo, o ecología organísmica, analiza las respuestas morfológicas, fisiológicas y de conducta de los organismos para confrontar su ambiente abiótico y cómo éste determina su distribución. La ecología de poblaciones se ocupa de los factores que afectan el tamaño, composición y distribución de un grupo reproductivo de individuos de la misma especie, en el espacio y tiempo. Por otra parte, debido a que una comunidad ecológica es un conjunto de poblaciones de distintas especies que ocupan un hábitat e interactúan entre sí, la ecología de comunidades estudia cómo las interacciones entre las especies afectan la estructura y composición del conjunto. Por lo tanto, las interacciones determinan la complejidad de una comunidad.
Finalmente, un ecosistema incluye tanto a la comunidad de especies como al ambiente abiótico de un área en particular, y en este sentido, la ecología de ecosistemas analiza cómo es el flujo de energía y el ciclo de elementos químicos, así como el papel de los organismos vivos.
